Copilote Pharmacie Hospitalière est par essence interfacé avec les différentes applications informatiques de l'établissement.

• Avec les logiciels de prescription : Pharma(R), DxC@re(R), Disporao(R), Crossway(R), Cortex(R), Calystène(R), Genois(R)...
• Avec les logiciels Gestion éco et financière : Magh2(R), Cpage(R), Hexagone(R), Sante400R), etc.
• Avec des logiciels spécialisés : Chimio, rétrocession, stérilisation etc.

Un dialogue s'établit à deux, il est nécessaire de bien anticiper la prise de contact avec les éditeurs tiers dès les premières réflexions sur le sujet.